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AlphaFold 3助力TCR抗原特异性预测

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AI 综述

研究人员利用AlphaFold 3预测MHC–抗原肽–TCR三元复合物结构,建立了不依赖特定抗原训练数据的TCR抗原特异性预测方法AF3-PTI-PAE。该方法在独立验证中对MHC I类和II类抗原的AUC中位数分别达0.92和0.81,并能识别此前缺乏结构信息的抗原表位。 研究覆盖超9,000种实验支持的TCR–抗原配对、1,000多个抗原表位及70多种MHC等位基因。

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报道时间线

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11月3日
  1. 智源社区
    基于AlphaFold 3的T细胞受体抗原特异性通用序列预测

    研究人员利用AlphaFold 3预测MHC–抗原肽–TCR三元复合物结构,建立了不依赖特定抗原训练数据的TCR抗原特异性预测方法AF3-PTI-PAE。该方法在独立验证中对MHC I类和II类抗原的AUC中位数分别达0.92和0.81,并能识别此前缺乏结构信息的抗原表位。研究覆盖超9,000种实验支持的TCR–抗原配对、1,000多个抗原表位及70多种MHC等位基因。

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